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Règne fongique : Menaces et possibilités

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À Propos

Grâce à la croissance explosive des données et aux progrès de l’intelligence artificielle (IA) pour les interpréter, le domaine de la biologie connaît une révolution. Aujourd’hui, il y a pour environ 50 milliards de dollars de données de séquençage d’ADN librement accessibles (100 millions de gigaoctets) et accumulées par les laboratoires du monde entier depuis quinze ans. Notre groupe de recherche mise sur le développement d’outils informatiques de pointe pour réanalyser toutes ces données et répondre à diverses questions comme : « Quels virus à ARN nous éludent? », « Pouvons-nous découvrir de nouveaux enzymes fongiques qui recyclent le plastique avec une ultragrande efficacité? » ou « Pouvons-nous repérer des gènes fongiques qui permettent la mise au point de nouveaux traitements anticancéreux? »

Prix

  • Bourse d’excellence Temerty en recherche médicale, Université de Toronto, 2024
  • Chercheur en début de carrière, Fondation Gairdner, 2023
  • Research Symbiont Award (ECR), Symposium du Pacifique sur la bioinformatique, 2023
  • Bourse postdoctorale Banting, Université de Cambridge, 2021
  • Bourse Roman M. Babicki, Université de la Colombie-Britannique, 2017, 2018

Publications Pertinentes

  • Edgar, R. C., Taylor, B., Lin, V., Altman, T., Barbera, P., Meleshko, D., Lohr, D., Novakovsky, G., Buchfink, B., Al-Shayeb, B., Banfield, J. F., de la Peña, M., Korobeynikov, A., Chikhi, R. et Babaian, A. (2022). Petabase-scale sequence alignment catalyses viral discovery. Nature, 602(7895), Article 7895. https://doi.org/10.1038/s41586-021-04332-2
  • Forgia, M., Navarro, B., Daghino, S., Cervera, A., Gisel, A., Perotto, S., Aghayeva, D. N., Akinyuwa, M. F., Gobbi, E., Zheludev, I. N., Edgar, R. C., Chikhi, R., Turina, M., Babaian, A., Di Serio, F. et de la Peña, M. (2023). Hybrids of RNA viruses and viroid-like elements replicate in fungi. Nature Communications, 14(1), 2591. https://doi.org/10.1038/s41467-023-38301-2
  • Gupta, P., Hiller, A., Chowdhury, J., Lim, D., Lim, D. Y., Saeij, J. P. J., Babaian, A., Rodriguez, F., Pereira, L. et Morales-Tapia, A. (2024). A parasite odyssey : An RNA virus concealed in Toxoplasma gondii. Virus Evolution, 10(1), veae040. https://doi.org/10.1093/ve/veae040

institut

Université de Toronto

Département

Département de génétique moléculaire et Centre Donnelly de recherche cellulaire et biomoléculaire

Éducation

  • Ph.D. (sciences médicales), Université de la Colombie-Britannique
  • HB.Sc. (biologie moléculaire et génétique), Université McMaster

Pays

Canada

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