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Anna Goldenberg

La nomination

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Titulaire de chaire en IA Canada-CIFAR

Développement du cerveau et de l’enfant

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À Propos

Titulaire de chaire en IA Canada-CIFAR – Nouveau mandat – 2019

Anna Goldenberg est titulaire d’une bourse Lebovic dans le cadre du programme Développement du cerveau et de l’enfant du CIFAR et d’une chaire de recherche en IA Canada-CIFAR à l’Institut Vecteur. Elle est professeure agrégée au département d’informatique de l’Université de Toronto, avec une nomination conjointe au département de statistique. Anna Goldberg est chercheuse principale pour le programme de génétique et de biologie du génome à l’Institut de recherche SickKids où elle est également titulaire d’une chaire de la famille Varma en informatique biomédicale et en intelligence artificielle.

Goldenberg met au point des méthodes d’apprentissage automatique qui associent divers ensembles de mesures biologiques et phénotypiques pour approfondir la compréhension de maladies humaines complexes, pour déterminer les meilleurs traitements et les résultats pour les patients, et pour guider la prise de décisions visant à améliorer la qualité de vie des patients.

Sa méthode d’intégration de données appelée Similarity Network Fusion est la première à intégrer les données du patient (omiques, imagerie, etc.) à l’aide de réseaux de patients. Cette méthode a permis d’améliorer les pronostics de survie pour cinq cancers différents.

Prix

  • Chaire de la famille Varma en informatique biomédicale et en intelligence artificielle, 2018
  • Chaire de recherche du Canada en médecine informatique, 2017
  • Prix du département d’informatique pour mentorat exceptionnel et engagement remarquable relatif au recrutement d’étudiants diplômés, Université de Toronto, 2016
  • Bourse de nouveau chercheur de l’Ontario, ministère de la Recherche et de l’Innovation, 2016
  • Prix de la meilleure affiche, réunion de jeunes chercheurs de l’Institut du cancer des IRSC, 2013

Publications Pertinentes

  • Corre, C., Shinoda, G., Zhu, H., Cousminer, D. L., Crossman, C., Bellissimo, C.,... Palmert, M. R. (2016). « Sex-specific regulation of weight and puberty by the Lin28/let-7 axis », The Journal of Endocrinology, 228(3):179-191.
  • Rampasek, L., Goldenberg, A. (2016). « Tensorflow: Biology’s gateway to deep learning? », Cell Systems, 2(1):12-14.
  • Saria, S., Goldenberg, A. (2015). « Subtyping: What it is and its role in precision medicine », IEEE Intelligent Systems, 30(4):70-75.
  • Colak, R., Kim, T., Kazan, H., Oh, Y., Cruz, M., Valladares-Salgado, A.,... Goldenberg, A. (2016). « JBASE: joint Bayesian analysis of subphenotypes and epistasis », Bioinformatics, 32(2):203-210.
  • Wang, B., Mezlini, A. M., Demir, F., Fiume, M., Tu, Z., Brudno, M.,... Goldenberg, A. (2014). « Similarity network fusion for aggregating data types on a genomic scale », Nature Methods, 11(3):333-337.

institut

Hôpital pour enfants malades

Hôpital pour enfants malades de Toronto

Institut Vecteur

Département

Génétique et biologie du génome, informatique

Éducation

  • PhD (apprentissage automatique), Université Carnegie Mellon
  • MSc (découverte de connaissances et exploration de données), Université Carnegie Mellon
  • BIng (génie mathématique et informatique), Université de Louisville

Pays

Canada

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