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Dans notre laboratoire de biologie computationnelle, nous étudions la biologie des systèmes aux échelles cellulaire et tissulaire. Nous élaborons des méthodes informatiques et une théorie écosystémique de la fonction tissulaire, en fonction de données génomiques de la cellule unique, qui tiennent compte des interactions intercellulaires, de la croissance cellulaire et des mécanismes intracellulaires, comme les voies, les réactions et les relations causales, afin de mieux comprendre le développement, le cancer et les processus de guérison des plaies régénératives.

Prix

  • Clarivate Analytics - Chercheurs les plus cités (années : 2014, 2016, 2018, 2019, 2020, 2021, 2022)

Publications Pertinentes

  • Richards LM,Whitley OKN, MacLeod G, Cavalli FMG, Coutinho F, Jaramillo J, Svergun N, Riverin M, Croucher D, Kushida M, Yu K, Guilhamon P, Rastegar N, Ahmadi M, Bhatti J, Bozek D, Li N, Lee L, Che C, Luis E, Park N, Xu Z, Ketela T, Moore R, Marra M, Spears, Cusimano M, Das S, Bernstein M, Haibe-Kains B, Lupien M, Luchman H, Weiss S, Angers S, Dirks PB, Bader GD, Pugh TJ (2021). Gradient of Developmental and Injury Response transcriptional states defines functional vulnerabilities underpinning glioblastoma heterogeneity. Nature Cancer, févr.2(2):157-173
  • MacParland SA, Liu, JC, Ma X, Innes BT, Bartczak AM, Gage BK, Manuel J, Khuu N, Echeverri J, Linares I, Gupta R, Cheng ML, Liu LY, Camat D, Chung SW, Seliga RK, Shao Z, Lee E, Ogawa S, Ogawa M, Wilson MD, Fish JE, Selzner M, Ghanekar A, Grant D, Greig P, Sapisochin G, Selzner N, Winegarden N, Adeyi O, Keller G, Bader GD, McGilvray ID (2018) Single cell RNA sequencing of human liver reveals distinct intrahepatic macrophage populations. Nat Communications, oct. 22;9(1):4383
  • Warde-Farley D, Donaldson SL, Comes O, Zuberi K, Badrawi R, Chao P, Franz M, Grouios C, Kazi F, Lopes CT, Maitland A, Mostafavi S, Montojo J, Shao Q, Wright G, Bader GD, Morris Q (2010) The GeneMANIA prediction server: biological network integration for gene prioritization and predicting gene function. Nucleic Acids Research, juill. 1;38 suppl:W214-20

institut

Université de Toronto

Département

Centre Donnelly

Éducation

  • Ph.D. (biochimie), Université de Toronto
  • B.Sc. (biochimie), Université McGill

Pays

Canada

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