{"id":21187,"date":"2018-08-02T13:22:49","date_gmt":"2018-08-02T17:22:49","guid":{"rendered":"https:\/\/cifar661.wpengine.com\/cifarnews\/2018\/08\/02\/atelier-sur-l-architecture-mol-culaire-de-la-vie-du-cifar-repousser-les-fronti-res-de-la-d-couverte-de-m-dicaments\/"},"modified":"2025-12-18T05:42:52","modified_gmt":"2025-12-18T10:42:52","slug":"atelier-sur-l-architecture-mol-culaire-de-la-vie-du-cifar-repousser-les-fronti-res-de-la-d-couverte-de-m-dicaments","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/cifar.ca\/fr\/cifarnews\/2018\/08\/02\/atelier-sur-l-architecture-mol-culaire-de-la-vie-du-cifar-repousser-les-fronti-res-de-la-d-couverte-de-m-dicaments\/","title":{"rendered":"Atelier sur l\u2019architecture mol\u00e9culaire de la vie du CIFAR : Repousser les fronti\u00e8res de la d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments"},"content":{"rendered":"<p>Cet atelier d\u2019introduction d\u2019un jour a r\u00e9uni des boursiers du programme Architecture mol\u00e9culaire de la vie du CIFAR et des dirigeants pharmaceutiques pour discuter des progr\u00e8s actuels, des d\u00e9fis et des occasions futures en mati\u00e8re de d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments.<\/p>\n<p>Les participants ont explor\u00e9 quatre th\u00e8mes principaux, soit\u00a0: lacunes actuelles en industrie, dynamique spatiotemporelle des biomol\u00e9cules, analyse de cellules individuelles et pharmacologie des syst\u00e8mes, et avenir de la prot\u00e9omique et de la biologie structurale. Les pr\u00e9sentateurs ont abord\u00e9 de nombreux sujets, notamment\u00a0: cibles m\u00e9dicamenteuses courantes, m\u00e9thodes novatrices pour d\u00e9pister les effets des m\u00e9dicaments, m\u00e9thodes et outils pour surveiller la dynamique des cibles m\u00e9dicamenteuses et l\u2019\u00e9volution de la maladie, et technologies novatrices d\u2019utilit\u00e9 clinique.<\/p>\n<p>Les participants ont relev\u00e9 plusieurs facteurs qui limitent actuellement la d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments, y compris la disponibilit\u00e9 d\u2019outils pour \u00e9valuer la dynamique spatiotemporelle dans diff\u00e9rents types tissulaires, le besoin de rehausser le partage de donn\u00e9es, l\u2019importance de d\u00e9crire plus en d\u00e9tail les conditions exp\u00e9rimentales, l\u2019absence d\u2019une signature du bien-\u00eatre et le recours \u00e0 des mod\u00e8les dans les premi\u00e8res \u00e9tapes du processus de la d\u00e9couverte qui ne refl\u00e8tent pas avec pr\u00e9cision les divers aspects de la maladie humaine. L\u2019\u00e9tablissement de valeurs de r\u00e9f\u00e9rence illustrant un \u00e9tat sain pour tous les types de biomol\u00e9cules nous permettrait de mieux comprendre les modifications associ\u00e9es \u00e0 la maladie et, en retour, pourrait mettre en lumi\u00e8re des cibles m\u00e9dicamenteuses \u00e9ventuelles. La discussion a permis de cerner plusieurs domaines o\u00f9 de plus amples recherches sont n\u00e9cessaires. Les contraintes susmentionn\u00e9es pourraient-elles expliquer les observations actuelles voulant que la plupart des m\u00e9dicaments \u00e9chouent \u00e0 cause d\u2019un probl\u00e8me associ\u00e9 \u00e0 l\u2019efficacit\u00e9, plut\u00f4t qu\u2019\u00e0 l\u2019innocuit\u00e9? Le manque d\u2019investissement dans une meilleure compr\u00e9hension biologique de la maladie, particuli\u00e8rement les maladies complexes, pourrait-il aussi contribuer \u00e0 l\u2019\u00e9chec de l\u2019efficacit\u00e9 des m\u00e9dicaments? Comme certains m\u00e9dicaments ne sont indiqu\u00e9s que chez une population tr\u00e8s sp\u00e9cifique et limit\u00e9e (par exemple, la pr\u00e9sence d\u2019une mutation sp\u00e9cifique), un meilleur profilage des patients pourrait-il mener \u00e0 une plus grande efficacit\u00e9 m\u00e9dicamenteuse?<\/p>\n<p>La discussion a aussi port\u00e9 sur des m\u00e9thodes qui pourraient am\u00e9liorer la d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments, comme l\u2019utilisation de mod\u00e8les biologiques pertinents qui reproduisent la maladie humaine avec plus de pr\u00e9cision (par ex., \u00e9chantillons de patients <em>ex vivo<\/em>), la combinaison de m\u00e9thodes (biologie structurale et computationnelle) et l\u2019association de plusieurs couches de donn\u00e9es \u00ab\u00a0omiques\u00a0\u00bb (prot\u00e9omique, m\u00e9tabolomique, g\u00e9nomique, lipidomique, etc.). La mise au point d\u2019autres outils est n\u00e9cessaire pour faciliter la fusion de ces ensembles de donn\u00e9es \u00e0 large \u00e9chelle.<\/p>\n<p>Il y a eu des pr\u00e9sentations et des discussions sur de pr\u00e9cieux outils pour la d\u00e9couverte de nouveaux m\u00e9dicaments et la surveillance de la r\u00e9action aux traitements\u00a0: transfert d\u2019\u00e9nergie par r\u00e9sonance bioluminescente, qui permet l\u2019\u00e9tude de la dynamique de la signalisation en temps r\u00e9els dans les cellules vivantes; fluorescence excit\u00e9e \u00e0 deux photons, qui permet de visualiser les structures subcellulaires dans la r\u00e9tine d\u2019animaux vivants; laser picoseconde infrarouge, qui permet une pr\u00e9cision chirurgicale au niveau de la cellule individuelle sans formation de tissu cicatriciel; lame de phase volta, une m\u00e9thode de contraste de phase pour la microscopie \u00e9lectronique \u00e0 transmission, et; r\u00e9sonance paramagn\u00e9tique \u00e9lectronique (EPR) et double r\u00e9sonance \u00e9lectron-\u00e9lectron (DEER), des m\u00e9thodes pour mesurer la distance entre les \u00e9tiquettes de spin et des sources ultra-brillantes d\u2019\u00e9lectrons qui permettent l\u2019observation des mouvements atomiques pendant des processus chimiques. On s\u2019attend \u00e0 ce que des am\u00e9liorations aux technologies actuelles, y compris des outils permettant leur combinaison, am\u00e9liorent la d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments. Finalement, un criblage \u00e0 haut rendement de microbiomes individuels pour \u00e9valuer les interactions entre les m\u00e9dicaments et le microbiome a r\u00e9v\u00e9l\u00e9 que la r\u00e9action \u00e0 divers m\u00e9dicaments homologu\u00e9s par la FDA diff\u00e8re entre les sujets et peut avoir de graves effets sur le microbiome. Cons\u00e9quemment, les participants se demandent s\u2019il ne faudrait pas analyser les effets sur le microbiome de nouveaux candidats-m\u00e9dicaments.<\/p>\n<h2><strong>S\u00c9ANCE\u00a01\u00a0: LACUNES ACTUELLES EN INDUSTRIE <\/strong><\/h2>\n<p>La premi\u00e8re s\u00e9ance, pr\u00e9sid\u00e9e par Michel Bouvier, Boursier principal du CIFAR, auteur principal et chef de la direction, Institute for Research in Immunology and Cancer, a port\u00e9 sur les lacunes actuelles en industrie et sur ce qu\u2019il faut pour d\u00e9couvrir la prochaine g\u00e9n\u00e9ration de m\u00e9dicaments. Les participants ont soulign\u00e9 le besoin de repousser les limites de la technologie actuelle et de cr\u00e9er des technologies qui se pr\u00eatent \u00e0 une plus grande communaut\u00e9 de chercheurs en transcendant les domaines. Il faut explorer et aborder comment la communaut\u00e9 scientifique peut avancer pour r\u00e9aliser des recherches qui ont un plus grand impact sur la d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments. La mise au point de technologies qui peuvent \u00e9clairer ce qui se passe \u00e0 l\u2019\u00e9chelle atomique et la cr\u00e9ation de cartes mol\u00e9culaires de la cellule pourraient mener \u00e0 une meilleure conception de m\u00e9dicaments.<\/p>\n<p><strong>R\u00c9SULTATS DE LA DISCUSSION DE GROUPE SUR LES LACUNES ACTUELLES EN INDUSTRIE<\/strong><\/p>\n<p><strong>L\u2019\u00e9tablissement de valeurs de r\u00e9f\u00e9rence illustrant un \u00e9tat sain faciliterait la d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments.<\/strong><\/p>\n<p>Afin de comprendre les changements biologiques d\u00e9taill\u00e9s qui se produisent dans la maladie, des valeurs de r\u00e9f\u00e9rence illustrant un \u00e9tat sain sont n\u00e9cessaires pour tous les types de biomol\u00e9cules. Une meilleure compr\u00e9hension des m\u00e9canismes d\u00e9taill\u00e9s en jeu dans l\u2019\u00e9volution d\u2019un \u00e9tat sain vers la maladie nous procurera de pr\u00e9cieuses donn\u00e9es sur des cibles m\u00e9dicamenteuses \u00e9ventuelles. Bien qu\u2019il y ait une masse de donn\u00e9es sur la maladie, il nous manque encore une signature du bien-\u00eatre. La surveillance de sujets au fil du temps avant la manifestation de la maladie permettrait d\u2019\u00e9tablir une signature du bien-\u00eatre. L\u2019analyse d\u2019\u00e9chantillons humains actuellement entrepos\u00e9s dans des banques de tissu pourrait faciliter l\u2019\u00e9tablissement de cette signature prot\u00e9ique du bien-\u00eatre.<\/p>\n<p><strong>L\u2019\u00e9largissement du partage de donn\u00e9es et une meilleure d\u00e9finition des conditions exp\u00e9rimentales des \u00e9chantillons peuvent am\u00e9liorer la d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments.<\/strong><\/p>\n<p>Il est essentiel de conna\u00eetre la structure des prot\u00e9ines pour d\u00e9couvrir des m\u00e9dicaments et, en associant la biologie structurale et computationnelle, on peut am\u00e9liorer la d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments (par ex., sur le plan de la puissance). Malgr\u00e9 la masse de donn\u00e9es \u00e9manant de la r\u00e9volution r\u00e9cente des \u00ab\u00a0omiques\u00a0\u00bb, les biologistes computationnels ont besoin de plus de donn\u00e9es de haute qualit\u00e9 pour dresser un portrait complet. Les participants ont soulign\u00e9 l\u2019importance de fournir des donn\u00e9es d\u00e9taill\u00e9es sur les conditions exp\u00e9rimentales et cela pourrait contribuer \u00e0 r\u00e9soudre le probl\u00e8me de la capacit\u00e9 limit\u00e9e de reproduction des r\u00e9sultats exp\u00e9rimentaux qu\u2019on qualifie de \u00ab\u00a0crise de la reproductibilit\u00e9\u00a0\u00bb. Le partage public des donn\u00e9es de fa\u00e7on coh\u00e9rente, qui permet leur interpr\u00e9tation interdisciplinaire, a aussi \u00e9t\u00e9 soulign\u00e9. Il faut explorer plus \u00e0 fond quelle serait la nature des infrastructures d\u2019entrep\u00f4ts de donn\u00e9es n\u00e9cessaires au partage coh\u00e9rent des donn\u00e9es.<\/p>\n<p><strong>Une analyse multi-omique serait avantageuse pour la d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments. <\/strong><\/p>\n<p>L\u2019association de plusieurs couches de donn\u00e9es omiques, comme la transcriptomique, la g\u00e9nomique, la lipidomique et la prot\u00e9omique, pourrait produire de pr\u00e9cieuses donn\u00e9es sur la d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments et les m\u00e9canismes d\u2019action. Toutefois, nous ne disposons pas encore des m\u00e9thodes n\u00e9cessaires pour combiner les donn\u00e9es omiques, ni des m\u00e9thodes qui permettraient une corr\u00e9lation significative des donn\u00e9es. Comme les prot\u00e9ines constituent l\u2019unit\u00e9 biologique fonctionnelle ultime, les donn\u00e9es prot\u00e9omiques se r\u00e9v\u00e8lent particuli\u00e8rement utiles pour la d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments. Actuellement, les donn\u00e9es transcriptomiques sont relativement abordables et on pr\u00e9dit que dans cinq \u00e0 dix ans le co\u00fbt des donn\u00e9es prot\u00e9omiques sera comparable.<\/p>\n<h2>S\u00c9ANCE\u00a02\u00a0: DYNAMIQUE SPATIOTEMPORELLE DES BIOMOL\u00c9CULES, ET ANALYSE DE CELLULES INDIVIDUELLES ET PHARMACOLOGIE DES SYST\u00c8MES<\/h2>\n<p>Robert H. Austin, conseiller du CIFAR et professeur \u00e0 l\u2019Universit\u00e9 de Princeton, a pr\u00e9sid\u00e9 cette s\u00e9ance qui a mis en vedette des pr\u00e9sentations de Michel Bouvier, Boursier principal du CIFAR, et auteur principal et chef de la direction de l\u2019Institute for Research in Immunology and Cancer, et de Krzysztof Palczewski, Boursier principal du CIFAR, et professeur et directeur du d\u00e9partement de pharmacologie \u00e0 l\u2019Universit\u00e9 Case Western Reserve.<\/p>\n<p><strong>MICHEL BOUVIER <\/strong><\/p>\n<p><strong>D\u00e9tection en temps r\u00e9el de la propagation des signaux dans les cellules vivantes<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li><strong>Les r\u00e9cepteurs coupl\u00e9s aux prot\u00e9ines G (RCPG) repr\u00e9sentent une part importante des cibles m\u00e9dicamenteuses.<\/strong> La signalisation des RCPG est pluridimensionnelle (capacit\u00e9 de susciter une vari\u00e9t\u00e9 d\u2019\u00e9v\u00e9nements de signalisation). \u00c0 titre d\u2019exemple de RCPG pertinent sur le plan physiologique, notons l\u2019AT1R (r\u00e9cepteur de l\u2019angiotensine), dont les ligands activent s\u00e9lectivement la \u03b2-arrestine et sont utiles dans les traitements cardiovasculaires.<\/li>\n<li><strong>Le transfert d\u2019\u00e9nergie par r\u00e9sonance bioluminescente (BRET) constitue une m\u00e9thode puissante pour surveiller la circulation des RCPG et se r\u00e9v\u00e8le ainsi utile dans la d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments<\/strong>. BRET permet l\u2019\u00e9tude de la dynamique de la signalisation en temps r\u00e9el dans les cellules vivantes. Le regroupement des profils de signalisation des m\u00e9dicaments permet la pr\u00e9diction des effets secondaires des m\u00e9dicaments.<\/li>\n<\/ul>\n<p><strong>KRZYSZTOF PALCZEWSKI<\/strong><\/p>\n<p><strong>Pharmacologie des syst\u00e8mes\u00a0: D\u00e9veloppement de m\u00e9dicaments gr\u00e2ce \u00e0 une nouvelle compr\u00e9hension des r\u00e9seaux cellulaires <\/strong><\/p>\n<ul>\n<li><strong>Des m\u00e9thodes qui permettent de surveiller l\u2019\u00e9volution de la maladie peuvent se r\u00e9v\u00e9ler utiles pour la d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments.<\/strong> La fluorescence excit\u00e9e \u00e0 deux photons (TPEF) permet de visualiser les structures subcellulaires dans la r\u00e9tine d\u2019animaux vivants et de dresser des cartes de la sensibilit\u00e9 visuelle. Cette technique d\u2019imagerie repr\u00e9sente un outil pr\u00e9cieux pour mieux comprendre la survenue et l\u2019\u00e9volution de la maladie, ainsi que sa r\u00e9action \u00e0 l\u2019intervention th\u00e9rapeutique.<\/li>\n<li><strong>Les maladies complexes requi\u00e8rent des m\u00e9thodes complexes.<\/strong> La pharmacologie des syst\u00e8mes peut nous aider \u00e0 r\u00e9pondre aux besoins m\u00e9dicaux des malvoyants.<\/li>\n<\/ul>\n<p><strong>R\u00c9SULTATS DE LA DISCUSSION DE GROUPE SUR LA DYNAMIQUE SPATIOTEMPORELLE DES BIOMOL\u00c9CULES, ET SUR L\u2019ANALYSE DE CELLULES INDIVIDUELLES ET DE LA PHARMACOLOGIE DES SYST\u00c8MES<\/strong><\/p>\n<p><strong>Nous ne disposons pas d\u2019outils pour \u00e9valuer la dynamique spatiotemporelle <em>in vitro<\/em>.<\/strong><\/p>\n<p>\u00c0 l\u2019\u00e9chelle d\u2019une cellule individuelle, il est impossible de capter la signature de l\u2019orientation spatiale et il est ardu de l\u2019\u00e9valuer, exception faite des outils con\u00e7us sp\u00e9cifiquement pour l\u2019\u0153il o\u00f9 il est possible d\u2019\u00e9valuer la r\u00e9action individuelle des b\u00e2tonnets et des c\u00f4nes, et o\u00f9 les m\u00eames cellules peuvent \u00eatre r\u00e9interrog\u00e9es. Quand on ne peut prendre en compte cette dynamique, on perd le contexte environnemental (c\u2019est-\u00e0-dire, les cellules adjacentes). De nombreux m\u00e9dicaments \u00e9chouent-ils parce qu\u2019il n\u2019y a pas d\u2019\u00e9valuation de la dynamique spatiotemporelle? La mise au point d\u2019outils efficaces, compatibles avec divers tissus, en vue d\u2019\u00e9valuer la dynamique spatiotemporelle am\u00e9liorerait-elle la d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments?<\/p>\n<p><strong>La plupart des m\u00e9dicaments n\u2019\u00e9chouent pas \u00e0 cause d\u2019un probl\u00e8me associ\u00e9 \u00e0 l\u2019innocuit\u00e9, mais plut\u00f4t en raison d\u2019un manque d\u2019efficacit\u00e9. <\/strong><\/p>\n<p>Cela souligne le besoin de mod\u00e8les plus pertinents pour mettre \u00e0 l\u2019essai des m\u00e9dicaments en stade pr\u00e9coce (probl\u00e8me d\u2019application). Plusieurs sont pass\u00e9s \u00e0 des syst\u00e8mes qui reproduisent la maladie humaine plus \u00e9troitement, y compris des \u00e9chantillons de patients <em>ex vivo<\/em> (c\u2019est \u00e0 dire, des organo\u00efdes). Compte tenu de l\u2019h\u00e9t\u00e9rog\u00e9n\u00e9it\u00e9 de certaines maladies (c\u2019est-\u00e0-dire, l\u2019h\u00e9t\u00e9rog\u00e9n\u00e9it\u00e9 tumorale), un meilleur profilage des patients pourrait aussi contribuer \u00e0 accro\u00eetre l\u2019efficacit\u00e9 des m\u00e9dicaments. L\u2019absence d\u2019\u00e9valuation de la dynamique spatiotemporelle pourrait-elle contribuer \u00e0 la mauvaise efficacit\u00e9 des m\u00e9dicaments?<\/p>\n<p><strong>Est-ce qu\u2019une meilleure compr\u00e9hension de la biologie en jeu permettrait d\u2019accro\u00eetre le taux de succ\u00e8s de la d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments?<\/strong><\/p>\n<p>Les maladies monog\u00e9niques, comme la fibrose kystique, constituent l\u2019objet principal de la d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments, car la cause est connue et une seule cible est n\u00e9cessaire. Dans le cas de maladies complexes, comme la schizophr\u00e9nie, nous ignorons les m\u00e9canismes pr\u00e9cis et cela vient entraver la d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments. Encore une fois, le manque de donn\u00e9es sur le bien-\u00eatre limite notre compr\u00e9hension des modifications biologiques qui ont cours dans la maladie. De plus, l\u2019h\u00e9t\u00e9rog\u00e9n\u00e9it\u00e9 dans la maladie entrave l\u2019apprentissage automatique, car il faudrait alors un grand nombre de points de donn\u00e9es coh\u00e9rents. La singularit\u00e9 du cancer pr\u00e9sente des complications pour l\u2019apprentissage automatique.<\/p>\n<p><strong>Pourrait-on am\u00e9liorer le taux de r\u00e9ussite de la d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments en modifiant le portefeuille de la d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments? <\/strong><\/p>\n<p>Pour de nombreuses maladies, aucun mod\u00e8le animal ne reproduit pleinement la maladie humaine. Cons\u00e9quemment, des pressions se font sentir pour passer directement des essais pr\u00e9cliniques sur l\u2019innocuit\u00e9 chez les animaux aux essais cliniques de phase\u00a01.<\/p>\n<h2><strong>S\u00c9ANCE\u00a03\u00a0: L\u2019AVENIR DE LA PROT\u00c9OMIQUE<\/strong><\/h2>\n<p>Krzysztof Palczewski, Boursier principal du CIFAR, professeur et directeur du d\u00e9partement de pharmacologie de l\u2019Universit\u00e9 Case Western Reserve, a pr\u00e9sid\u00e9 cette s\u00e9ance qui a mis en vedette des pr\u00e9sentations de R.J. Dwayne Miller, codirecteur du programme Architecture mol\u00e9culaire de la vie, Boursier principal du CIFAR et directeur de l\u2019Institut Max-Planck, et de Daniel Figeys, Boursier principal du CIFAR et directeur du d\u00e9partement de biochimie, de microbiologie et d\u2019immunologie de l\u2019Universit\u00e9 d\u2019Ottawa.<\/p>\n<p><strong>R.J. DWAYNE MILLER<\/strong><\/p>\n<p><strong>D\u00e9passer les limites spatiotemporelles fondamentales de l\u2019imagerie cellulaire\u00a0: Feuille de route technologique pour dresser une carte mol\u00e9culaire de la cellule.<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li><strong>Perc\u00e9es pour d\u00e9passer les limites fondamentales de la chirurgie et du biodiagnostic \u00e0 effraction minimale.<\/strong> Les lasers conventionnels qui produisent de longues impulsions entra\u00eenent une chaleur excessive et peuvent br\u00fbler les tissus. Le laser picoseconde infrarouge (PIRL) surmonte ce probl\u00e8me de br\u00fblure tissulaire, car il \u00e9nergise les mol\u00e9cules d\u2019eau dans les tissus pour l\u2019ablation. Cette technologie permet une pr\u00e9cision chirurgicale au niveau de la cellule individuelle sans formation de tissu cicatriciel. De plus, il a \u00e9t\u00e9 observ\u00e9 que le laser PIRL causait une activation moins importante de la signalisation de la \u03b2-cat\u00e9nine et du TGF-\u03b2 et cela, en retour, diminuait quantitativement l\u2019inflammation. Pendant l\u2019utilisation de cette technologie, on a d\u00e9couvert qu\u2019il \u00e9tait possible d\u2019extraire des prot\u00e9ines et des virus intacts des \u00e9chantillons, et ces prot\u00e9ines et virus conservaient pleinement leur fonction biologique. Compte tenu de cette observation, serait-il possible d\u2019associer cette technique avec d\u2019autres afin d\u2019\u00e9tudier plus \u00e0 fond ces biomol\u00e9cules et ces virus pleinement fonctionnels?<\/li>\n<li>Il est maintenant possible de r\u00e9aliser la cartographie spatiale des tissus.<\/li>\n<li>Des chercheurs ont d\u00e9couvert un nouveau processus d\u2019ablation laser qui maintient l\u2019int\u00e9grit\u00e9 de mol\u00e9cules de grande taille en phase gazeuse. \u00e0 \u00e9chantillonnage de 100\u00a0nm avec une d\u00e9tection qui se situe presque au niveau de la prot\u00e9ine individuelle par spectroscopie de masse. Parmi les applications futures, notons la greffe de corn\u00e9e sans risque.\n<ul>\n<li>En effectuant une d\u00e9sorption \u00e0 l\u2019aide de l\u2019excitation vibratoire impulsive (DIVE), le laser PIRL peut extraire des prot\u00e9ines en phase gazeuse des tissus que l\u2019on peut ensuite analyser par spectroscopie de masse. Cette m\u00e9thode permet une cartographie spatiale <em>in situ<\/em> et offre la possibilit\u00e9 de d\u00e9finir la fronti\u00e8re entre les tissus canc\u00e9reux et non canc\u00e9reux.<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n<\/ul>\n<p><strong>DANIEL FIGEYS<\/strong><\/p>\n<p><strong>Une nouvelle plateforme de criblage de microbiomes individuels. <\/strong><\/p>\n<ul>\n<li><strong>Introduction d\u2019une m\u00e9thode de criblage \u00e0 haut rendement de microbiomes individuels pour \u00e9valuer les interactions entre les m\u00e9dicaments et le microbiome<\/strong> appel\u00e9 RapidAIM (essai rapide d\u2019un microbiome individuel) v2.0. Cette m\u00e9thode implique la croissance <em>in vivo<\/em> du microbiote d\u2019une personne expos\u00e9e \u00e0 diff\u00e9rents compos\u00e9s avec une \u00e9valuation par m\u00e9taprot\u00e9omique. Cette m\u00e9thode a produit de fortes corr\u00e9lations entre la r\u00e9action <em>in vivo<\/em> et <em>in vitro<\/em> relativement \u00e0 la composition de la communaut\u00e9 bact\u00e9rienne et des voies touch\u00e9es.<\/li>\n<li><strong>Proposition d\u2019analyser tous les nouveaux candidats-m\u00e9dicaments quant \u00e0 leurs effets sur le microbiome.<\/strong> La r\u00e9action du microbiome \u00e0 diff\u00e9rents m\u00e9dicaments homologu\u00e9s par la FDA diff\u00e8re d\u2019une personne \u00e0 l\u2019autre. Les anti-inflammatoires non st\u00e9ro\u00efdiens (AINS) peuvent avoir un effet dramatique sur le microbiome. Il se produit des changements dans les voies m\u00e9taboliques m\u00eame quand la quantit\u00e9 de bact\u00e9ries ne change pas.<\/li>\n<\/ul>\n<p><strong>R\u00c9SULTATS DE LA DISCUSSION DE GROUPE SUR L\u2019AVENIR DE LA PROT\u00c9OMIQUE<\/strong><\/p>\n<p><strong>Faudrait-il garantir l\u2019innocuit\u00e9 des nouveaux candidats-m\u00e9dicaments pour le microbiome?<\/strong><\/p>\n<p>Comme la r\u00e9action du microbiome \u00e0 divers m\u00e9dicaments homologu\u00e9s par la FDA diff\u00e8re d\u2019une personne \u00e0 l\u2019autre, les nouveaux candidats-m\u00e9dicaments devraient-ils faire l\u2019objet d\u2019une \u00e9preuve d\u2019innocuit\u00e9 pour le microbiome? De plus, devrait-on classer les m\u00e9dicaments en fonction de leurs effets sur le microbiome? Apr\u00e8s une exposition aux antibiotiques, certains microbiomes sont incapables de se r\u00e9tablir et des r\u00e9sultats pr\u00e9liminaires ont d\u00e9montr\u00e9 que certains m\u00e9dicaments homologu\u00e9s par la FDA, qui n\u2019appartiennent pas \u00e0 la famille des antibiotiques, peuvent avoir des cons\u00e9quences sur le microbiome qui ressemblent \u00e0 celles entra\u00een\u00e9es par un antibiotique. Si on allait de l\u2019avant avec ces \u00e9preuves, il faudrait alors cerner la composition d\u2019un microbiome \u00ab\u00a0sain\u00a0\u00bb.<\/p>\n<p><strong>Le laser infrarouge picoseconde (PIRL) compte de nombreuses applications cliniques \u00e9ventuelles.<\/strong><\/p>\n<p>Le laser PIRL ne devrait pas causer de dommages \u00e0 la couche \u00e9pith\u00e9liale de la corn\u00e9e, car il a \u00e9t\u00e9 utilis\u00e9 dans l\u2019\u0153il \u00e0 de nombreuses reprises sans entra\u00eener la formation de tissu cicatriciel. Cons\u00e9quemment, le laser PIRL pourrait se r\u00e9v\u00e9ler utile dans le traitement de la cataracte, car la modalit\u00e9 th\u00e9rapeutique actuelle implique l\u2019utilisation d\u2019une aiguille et de l\u2019administration d\u2019ondes de choc avec aspiration qui peuvent endommager la corn\u00e9e. De plus, le laser PIRL peut se pr\u00eater \u00e0 des biopsies du foie et \u00e0 l\u2019administration de m\u00e9dicaments. Pourrait-on appliquer cette technologie aux m\u00e9tastases? Comme les m\u00e9tastases sont inop\u00e9rables, serait-il avantageux d\u2019enlever les tumeurs m\u00e9tastatiques? Il est \u00e0 noter que les virus peuvent passer \u00e0 la phase gazeuse \u00e0 l\u2019aide de cette technologie et qu\u2019elle est donc class\u00e9e comme un risque biologique; le virus de la mosa\u00efque du tabac a pu infecter une feuille.<\/p>\n<h2><strong>S\u00c9ANCE\u00a04\u00a0: L\u2019AVENIR DE LA BIOLOGIE STRUCTURALE<\/strong><\/h2>\n<p>Daniel Figeys, Boursier principal du CIFAR et pr\u00e9sident du d\u00e9partement de biochimie, de microbiologie et d\u2019immunologie de l\u2019Universit\u00e9 d\u2019Ottawa, a pr\u00e9sid\u00e9 cette s\u00e9ance qui a mis en vedette des pr\u00e9sentations d\u2019Oliver Ernst, codirecteur du programme Architecture mol\u00e9culaire de la vie, Boursier principal du CIFAR et professeur \u00e0 l\u2019Universit\u00e9 de Toronto, et de R.J. Dwayne Miller, codirecteur du programme Architecture mol\u00e9culaire de la vie, Boursier principal du CIFAR et directeur de l\u2019Institut Max-Planck.<\/p>\n<p><strong>OLIVER ERNST<\/strong><\/p>\n<p><strong>Progr\u00e8s actuel dans notre compr\u00e9hension de la structure des RCPG.<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li><strong>Comme les r\u00e9cepteurs coupl\u00e9s aux prot\u00e9ines\u00a0G (RCPG) repr\u00e9sentent une part importante des cibles m\u00e9dicamenteuses, une meilleure compr\u00e9hension de leur structure est tr\u00e8s utile pour am\u00e9liorer la d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments. <\/strong>Environ 3\u00a0pour cent du g\u00e9nome humain se compose de RCPG et environ 34\u00a0pour cent des m\u00e9dicaments d\u2019ordonnance ciblent environ 100\u00a0RCPG. On a r\u00e9solu la structure de 50\u00a0RCPG diff\u00e9rents, mais on a r\u00e9solu l\u2019\u00e9tat actif, inactif et interm\u00e9diaire de seulement 3\u00a0RCPG. La structure de la rhodopsine inactive et active a \u00e9t\u00e9 r\u00e9solue, mais il n\u2019y a pas de donn\u00e9es structurales sur les \u00e9tats interm\u00e9diaires.<\/li>\n<li><strong>Outils pour \u00e9tudier des structures macromol\u00e9culaires.<\/strong> La lame de phase Volta (VPP), une m\u00e9thode de contraste de phase dans la microscopie \u00e9lectronique \u00e0 transmission (TEM), se compose d\u2019une fine pellicule de carbone continue (environ 10\u00a0nm) au dos du plan focal de la lentille de l\u2019objectif et permet un contraste de phase au foyer. La r\u00e9sonance paramagn\u00e9tique \u00e9lectronique (EPR) et la double r\u00e9sonance \u00e9lectron-\u00e9lectron (DEER) sont des m\u00e9thodes qui mesurent la distance entre les \u00e9tiquettes de spin.<\/li>\n<\/ul>\n<p><strong>R.J. DWAYNE MILLER<\/strong><\/p>\n<p><strong>M\u00e9thodes pour l\u2019analyse structurale et l\u2019imagerie en solution \u00e0 haut rendement.<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li><strong>Cartographie des mouvements atomiques avec des sources ultra-brillantes d\u2019\u00e9lectrons\u00a0: r\u00e9alisation d\u2019une exp\u00e9rience de la pens\u00e9e en chimie<\/strong>. L\u2019objectif est de mettre au point le fondement d\u2019un mode r\u00e9actif en chimie, au-del\u00e0 de l\u2019utilisation des fl\u00e8ches courbes, et d\u2019\u00e9claircir la physique des dimensionnalit\u00e9s r\u00e9duites. Les sources ultra-brillantes d\u2019\u00e9lectrons ont contribu\u00e9 \u00e0 l\u2019atteinte de l\u2019objectif de longue date d\u2019observer les mouvements atomiques pendant les processus chimiques avec une r\u00e9solution temporelle de dix\u00a0femtosecondes. Pendant le processus <em>in situ<\/em> d\u2019une infection par le bact\u00e9riophage\u00a0T4, il est possible de discerner le bact\u00e9riophage plein et vide. Pendant l\u2019imagerie de 30\u00a0minutes de la lib\u00e9ration virale, il est possible d\u2019\u00e9chantillonner diff\u00e9rentes orientations de la m\u00eame particule, et les structures virales individuelles concordent bien avec les donn\u00e9es de cryomicroscopie \u00e9lectronique et de tomographie.<\/li>\n<\/ul>\n<p><strong>R\u00c9SULTATS DE LA DISCUSSION DE GROUPE SUR L\u2019AVENIR DE LA BIOLOGIE STRUCTURALE <\/strong><\/p>\n<p><strong>La cryomicroscopie \u00e9lectronique est un outil pr\u00e9cieux pour \u00e9tudier les structures biologiques. L\u2019am\u00e9lioration de cette technique et son association \u00e0 d\u2019autres technologies am\u00e9lioreront d\u2019autant plus la d\u00e9couverte de m\u00e9dicaments<\/strong>. Bien que de meilleurs logiciels et d\u00e9tecteurs puissent am\u00e9liorer la cryomicroscopie \u00e9lectronique, la pr\u00e9paration des \u00e9chantillons est un facteur limitatif. Les \u00e9chantillons doivent \u00eatre homog\u00e8nes et il faut en tenir compte lors de l\u2019\u00e9tablissement de liens avec la biologie. Pour dresser le portrait complet d\u2019une interaction m\u00e9dicamenteuse, les photographies statiques ne suffisent pas. La r\u00e9alisation de films serait utile pour \u00e9valuer si un m\u00e9dicament atteint sa cible et s\u2019y lie.<\/p>\n<p><button class=\"pdf-btn-link cifar_btn_link\" data-href=\"https:\/\/cifar.ca\/wp-content\/uploads\/2020\/01\/mal-pharma-roundtable-fr.pdf\" data-target=\"_blank\" rel=\"noopener\">T\u00e9l\u00e9charger le PDF<\/button><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Cet atelier d\u2019introduction d\u2019un jour a r\u00e9uni des boursiers du programme Architecture mol\u00e9culaire de la vie du CIFAR et des dirigeants pharmaceutiques pour discuter des [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":65,"featured_media":31520,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[3860,932,926],"tags":[],"class_list":["post-21187","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-compte-rendu-devenement","category-industrie-et-technologie","category-mobilisation-du-savoir"],"acf":[],"yoast_head":"<!-- This site is optimized with the Yoast SEO plugin v27.2 - 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