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En biologie contemporaine, l’analyse d’objets biologiques complexes est limitée par le temps d’observation. Des instantanés moléculaires à haute résolution des cellules sont possibles grâce à diverses technologies de génomique et de génomique unicellulaire, mais ces technologies requièrent la destruction des échantillons, ce qui exclut l’analyse de la dynamique des animaux. Pour résoudre ce problème, nous mettons au point des systèmes d’enregistrement d’événements d’ADN par lesquels les données moléculaires et cellulaires dans les cellules individuelles d’un organisme multicellulaire sont progressivement stockées dans des bandes d’ADN synthétiques intégrées aux cellules. Un tel système permet la lecture des profils d’expression moléculaire historiques de nombreuses cellules à l’aide d’un séquençage unicellulaire à haut débit. En mettant à profit la biologie synthétique, l’ingénierie génomique, l’ingénierie cellulaire et les méthodes computationnelles, nous concevons des systèmes de « capteurs », d’« écriture », de « mémoire » et de « lecture » pour l’enregistreur vidéo de la cellule.

Prix

  • Chercheur émérite, Institut Allen, 2022
  • Chaire de recherche du Canada en biologie synthétique, Instituts de recherche en santé du Canada, 2020
  • Prix du ministre pour les jeunes scientifiques, ministère de l’Éducation et des Sciences, Japon, 2020
  • Bourse de recherche PRESTO, Agence japonaise pour la science et la technologie (JST) 2014
  • Bourse postdoctorale Banting, Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie du Canada, 2012

Publications Pertinentes

  • Masuyama, N., Konno, N. et Yachie, N. (2022) Molecular recorders to track cellular events. Science 377, 469-470. DOI: 10.1126/science.abo3471
  • Konno, N., Kijima, Y., Watano, K., Ishiguro, S., Ono, K., Tanaka, M., Mori, H., Masuyama, N., Pratt, D., Ideker, T., Iwasaki, W. et Yachie, N. (2022) Deep distributed computing to reconstruct extremely large lineage trees. Nature Biotechnology 40, 566–575. DOI: 10.1038/s41587-021-01111-2
  • Sakata, R.C., Ishiguro, S., Mori, H., Tanaka, M., Tastuno, K., Ueda, H., Yamamoto, S., Seki, M., Masuyama, N., Nishida, K., Nishimasu, H., Arakawa, K., Kondo, A., Nureki, O., Tomita, M., Aburatani, H. et Yachie, N. (2020) Base editors for simultaneous introduction of C-to-T and A-to-G mutations. Nature Biotechnology 38, 865-869. DOI: 10.1038/s41587-020-0509-0

institut

Université d’Osaka

Université de la Colombie-Britannique

Université de Tokyo

Département

École de génie biomédical, Premium Research Institute for Human Metaverse Medicine (PRIMe), Centre de recherche en sciences et technologies avancées

Éducation

  • Ph.D. (biologie des systèmes), Université Keio
  • M.M.G. (bioinformatique), Université Keio
  • B.A. (information environnementale), Université Keio

Pays

Canada

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